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用Clean SEA-HSQC NMR谱观察非氘代的蛋白质表面氨基酸残基(英文)

林东海;时港洪;崔艳芳;朱广

  蛋白质表面的氨基酸残基往往直接参与蛋白质-配体的相互作用,而蛋白质内部的残基较少参与这种相互作用。本工作提出 Clean SEA-HSQC 交换谱,用来记录蛋白质表面能与溶剂发生交换的氨基酸残基信号,以减少蛋白质 NMR 谱谱峰严重重迭的问题。该方法可应用于非氘代的蛋白质样品,不仅可以有效地消除交换谱中来源于脂肪族基团(CHn)的分子内或分子间的 NOE 假峰和来源于快交换侧链基团(OH,NH_2)的 exchange-relayed NOE 假峰,而且可以很好地抑制混合期内纵向驰豫过程造成的假峰。Clean SEA-HSQC 或 CleaJl SEA-TROSY 实验可用来确定蛋白质-配体的结合部位,测量胺基质子与水分子的交换率,等等。……   
[关键词]:SEA;氨基酸残基;Clean SEA-HSQC NMR
[文献类型]:会议论文
[文献出处]: 《第十二届全国波谱学学术会议论文摘要集2002年