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江苏水稻黑条矮缩病病毒的RT-PCR检测

杨杰;王军;陈志德;仲维功

  为了明确江苏新发生的矮缩病害为水稻黑条矮缩病毒病,采用 RT-PCR 和序列测定方去对其病原进行了精确鉴定。根据水稻黑条矮缩病病毒基因组序列的信息,设计扩增 RNA 聚合酶基因、外壳蛋白基因和 RNA 沉默抑制子基因以及核心蛋白基因部分编码区的4对引物,提取感染水稻黑条矮缩病病毒的水稻植株总 RNA 并进行 RT-PCR 扩增,可以在感病植株中分别扩增出稻黑条矮缩病病毒基因组特有的4个条带。测序结果表明,来源于江苏南京的分离物的4个基因部分编码片段与已登录的对应基因片段核苷酸序列同源性达99%以上,共发现7个碱基的突变。经生物信息学分析,7个单碱基突变都是同义突变,氨基酸序列没有改变。根据以上结果确认该病病原为水稻黑条矮缩病病毒。利用该方法可以对水稻和其他寄主进行早期病毒检测。……