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不结球白菜亲缘关系的AFLP分析

刘晓明;李维为;王新华;陈榕华;陈火英

  白菜是十字花科芸薹属的基本种之一,为了在较短时间内培育出高产稳产品系,一些骨干亲本或自交系往往用作部分品种的共同亲本,客观上缩小了品种间的遗传差异性,使得这些差异很难在形态学和同工酶上表现出来。为此,迫切需要一种准确、快速鉴定品种的方法。分子标记技术的日益成熟和普及,使得分子标记在白菜亲缘关系的分析鉴定方面也将起到越来越重要的作用。DNA分子标记技术在植物分类学及遗传多样性、农作物种质资源保存、品种纯度及亲缘关系鉴定、遗传图谱构建、基因定位与辅助选择育种等研究方面均取得较好的应用效果,它的发展具有巨大的应用潜力和广阔的应用前景。本试验采用AFLP技术,对115份来自不同地区的不结球白菜材料进行亲缘关系分析,同时利用所有材料的叶表面光滑度、叶片边缘、叶片颜色、叶片形状、叶片厚度、叶柄颜色、叶片绒毛、开花时间、自交亲和性、种皮颜色等10个主要农艺性状采用DPS软件使用离差平方和聚类方法进行聚类,并比较两种聚类方法的差异。结果显示,从60对AFLP引物组合中共筛选到10对表现稳定,多态性较高的引物。不同引物组合检测多态性谱带的能力有很大的差异,多态性谱带的数量从9条到42条不等。其中E32M50组合是大白菜十分高效的引物组合,共产生46条清晰的扩增带,其中有42条多态性谱带,多态性谱带的百分率为91%。如图1所示。通过该引物组合,能将115份材料全部区分开来。AFLP统计分析将供试所有材料分类为2大类,每个类下面各有2个组,每个组下面各有2个亚组。农艺性状聚类分析将所有材料分为2大类,第二类下面有3个组。如图2所示。通过对比AFLP分类中Ⅰ类的Ⅰ组与农艺性状分类中的Ⅱ类Ⅱ组中的分类材料较一致,AFLP分类中Ⅰ类Ⅱ组Ⅰ亚组与农艺性状分类中Ⅱ类Ⅰ组分类材料较一致,AFLP分类中Ⅰ类Ⅱ组Ⅱ亚组与农艺性状分类中Ⅰ类分类材料较一致,AFLP分类中Ⅱ类与农艺性状分类中Ⅱ类Ⅲ组分类材料较一致。从农艺性状的聚类树状图中观察到一些材料未分离开,分析其原因可能有2种,一种是因为这些材料是从不同的地方搜集来的,可能是同一种品种或者极其相似;还有一种可能是选择的农艺性状指标不能将它们很好的分离开。两种聚类方法的结果大体类别一致,农艺性状未分离开的一些材料在AFLP的聚类树状图中被分成了几个小类,且所用的几个引物可以把所有的材料都区分开,这也充分证明分子标记聚类的优越性。本次聚类分析揭示了这些材料之间的亲缘关系,从分子水平上为以后品种的选育提供了理论依据。同时也表明AFLP标记用于研究品种指纹图谱,并鉴别品种亲缘关系是完全可行的。……