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基于基因表达谱的途径筛选肺腺癌治疗药物

王桂平;叶云;杨晓勤;陈新美;梁爽;郑文岭;马文丽

  目的:探讨基于基因表达谱的途径在肺腺癌治疗药物筛选中的应用。方法:从GEO数据库中获得GSE10072和GSE7670两个数据集,然后利用dchip软件进行差异表达基因分析,采用基因集富集方法(gene set enrichment analysis,GSEA)对肺腺癌进行通路富集分析,最后通过Connectivity map(Cmap)筛选肺腺癌候选治疗化合物,并进行实验验证。结果:共获得差异表达基因379个,其中上调基因94个,下调基因285个;GSEA主要富集到细胞周期等18条信号通路与肺腺癌相关;通过Cmap分析,筛选到Vorinos-tat、15-delta prostaglandin J2、trichostatin A、tanespi mycin等8种候选药物或化合物,在进一步的实验中也证实15d-PGJ(2)可有效抑制A549细胞的增殖。结论:基于基因表达谱的途径为药物发现提供新思路,加速了药物发现过程。……   
[关键词]:基因表达谱;肺腺癌;Connectivity map
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《中国临床药理学与治疗学2010年03期