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甘蔗TB1基因的克隆与生物信息学分析

李旭娟;林秀琴;刘洪博;李纯佳;徐超华;刘新龙

  以负调控禾本科植物分蘖的关键基因TB1为研究对象,根据水稻、玉米、高粱TB1同源基因保守序列设计引物,使用RT-PCR方法和RACE技术从甘蔗茎尖处克隆到该基因的同源基因Sc TB1。Sc TB1 c DNA全长1 668 bp,包含274 bp的5′UTR,1 149 bp的CDS和245 bp的3′UTR。生物信息学分析表明该基因可编码382个氨基酸残基,编码产物含有保守的SP区、TCP区和R区,属于TCP家族转录因子。其分子量为40.7 ku,理论等电点为8.55,蛋白亚细胞定位预测其主要定位于细胞质。系统进化分析表明Sc TB1属于CYC/TB1亚族蛋白,与高粱TB1和玉米TB1聚为一个亚类。根据序列的保守性和预测结果可推测Sc TB1很可能也参与了甘蔗分蘖性状的调控。……   
[关键词]:甘蔗;分蘖;TB1基因;克隆;生物信息学分析
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《热带作物学报2015年11期
[格式]:PDF原版; EPUB自适应版(需下载客户端)