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果蔗Hsp90基因的电子克隆及序列分析

林生;潘大仁;周以飞;陈观水;张绪璋;张燕云

  以克隆到的果蔗HSP90基因片段作为探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得一个全长为2097bp的cDNA序列。通过ORF软件分析,预测得到的蛋白质具有698个氨基酸。应用生物信息学对果蔗HSP90蛋白的理化性质、二级结构、疏水性/亲水性、信号肽、功能结构域分析及其蛋白功能、高级结构和同源性进行了预测分析。结果表明,该蛋白的相对分子量为80.2ku,在N端有一个ATP结合位点,具有内源ATPase活性。序列分析表明,该蛋白可能具有信号转导、转录调控、胁迫应答、生长因子等功能。利用梢腐病病原Gibberella fujikuroi接种果蔗福安叶片,检测到HSP90基因的转录水平逐渐提高。……   
[关键词]:果蔗;HSP90基因;电子克隆;生物信息学
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《热带作物学报2009年12期
[格式]:PDF原版; EPUB自适应版(需下载客户端)