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罗非鱼谷胱甘肽过氧化物酶1基因的克隆与分析

曹艳林;柯浩;刘振兴;张建騑;林敏

  采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术,克隆了罗非鱼(Oreochromis niloticus)谷胱甘肽过氧化物酶1(glutathione peroxidase1,GPx1)基因完整的编码序列(complete coding se-quence,CDS)。GPx1基因全长984bp,5′UTR56bp,CDS576bp,3′UTR352bp,PolyA20bp;第791~885位碱基(位于3′UTR)形成1个硒半胱氨酸插入序列(selenocysteine insertion sequence,SECIS),协助174~176位密码子TGA(UGA)编码1个硒半胱氨酸(Sec)。GPx1包含191个氨基酸,分子量21.8kDa,等电点8.04,无信号肽和潜在的N-糖基化位点。蛋白结构分析表明该基因编码蛋白为非跨膜蛋白。序列比对显示,GPx1单体具有Sec、Trp、Gln和Asn构成的催化四联体。罗非鱼GPx1与其他脊椎动物GPx1相比较,核苷酸序列相似性为43.2%~58.2%,氨基酸序列相似性为58.1%~80.6%。进化分析显示,处在分类学上不同纲的脊椎动物GPx1分别占据了不同分支。利用Swiss-Model预测了罗非鱼GPx1的3D结构,序列分析显示,GPx1可以形成1个同源四聚体。……   
[关键词]:罗非鱼;谷胱甘肽过氧化物酶1;基因克隆
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《南方水产2010年03期