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巴西橡胶树LIM结构域基因克隆与生物信息学分析

吴瑞;朱家红;张全琪;张治礼

  根据乙烯利刺激巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)胶乳差异表达cDNA文库的EST序列信息,利用RACE技术从胶乳中成功克隆了1个含有LIM结构域的未知功能新基因HbLIM的全长cDNA。生物信息学分析表明,该基因全长cDNA由1016bp的碱基组成,拥有1个570bp的开放阅读框编码189个氨基酸残基;推测氨基酸序列富含Lys,Ser,Ala和Leu,含有2个LIM结构域和2个N-豆蔻酰化位置。序列相似性分析表明,HbLIM编码的氨基酸序列与蓖麻、杨毛、葡萄相应的LIM基因的相似性高达98%,95%和92%。这些研究结果为深入探讨LIM结构域蛋白在巴西橡胶树乳管发育及乳管代谢中的功能奠定了基础。……   
[关键词]:巴西橡胶树;基因克隆;LIM基因;生物信息学
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《热带生物学报2010年01期
[格式]:PDF原版; EPUB自适应版(需下载客户端)