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西尼罗病毒的基因进化分析

宋捷;唐泰山;张常印;雷治海;孙旭辉;王凯民

  为更好的了解西尼罗病毒在世界各地的流行特征,从GenBank中随机选取45株西尼罗病毒的全基因或部分基因序列,进行同源性分析构建了基因进化树。发现西尼罗病毒可以分为两个谱系,1系病毒广泛分布在非洲西部、中东、东欧、印度、美国和澳大利亚等地,2系病毒分布在非洲亚撒哈拉、马达加斯加等地。1系的西尼罗病毒可进一步分为3个分支。对其中的22株西尼罗病毒部分基因序列进行同源性比较,发现1系病毒之间核苷酸同源在76.8%以上,氨基酸同源性在78.3%以上,而2系病毒与1系病毒核苷酸同源性约为64.7%~76.2%,氨基酸同源性约为64.7%~93.0%。……   
[关键词]:西尼罗病毒;基因进化树;核苷酸同源性;氨基酸同源性
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《动物医学进展2007年01期