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基于CATS法的江豚SNPs位点筛选

李树珍;万慧荣;杨光

  通过比较锚定序列示踪(Comparative Anchor Tagged Sequences,CATS)法,选择人、小鼠及其它哺乳动物中已知的5对CATS引物,通过PCR反应从江豚(Neophocaena phocaenoides)基因组中扩增出相应的DNA片段,结合变性高效液相色谱(Denaturing High Performance Liquid Chromatography,DHPLC)和DNA直接测序等技术,进行江豚单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点的筛选。通过不同个体同源序列的比对分析,发现其中的4个DNA片段具有多态性,共检测出7个SNPs位点,即大约每370bp出现1个SNPs。本研究为进一步利用CATS法获得江豚及其它野生动物种群的SNPs位点并进行种群遗传学分析奠定了基础。……   
[关键词]:江豚;SNPs;CATS;DHPLC
[文献类型]:期刊
[文献出处]: 《动物学报2008年04期
[格式]:PDF原版; EPUB自适应版(需下载客户端)