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滩羊3号染色体遗传连锁图谱构建及羊毛性状QTL探测

张卿

   本研究利用滩羊与小尾寒羊杂交的8个父系半同胞参考家系共576个个体,分析了绵羊基因组3号染色体上13个微卫星标记的等位基因频率、多态信息含量和群体杂合度,构建了3号染色体遗传连锁框架图谱,采用差异群体设计对影响滩羊10个表型性状的数量性状位点进行了检测研究,表型性状包括:初生重、二毛期活重、初生毛长、初生弯曲数、肩部弯曲数、股部弯曲数、毛股花穗类型、毛股紧实度、花案清晰度、弯曲比例。 所选的微卫星标记在参考群体中平均检测到11个(5~20个)等位基因,平均多态信息含量为0.5778 ( 0.2042~0.8320 ),群体杂合度平均值为0.5951(0.2094~0.8459)。13个标记中有9个呈现高度多态性,2个呈现中度多态性,2个呈现低度多态性,为该群体分子水平上的研究提供了可靠的依据。 构建的滩羊第3号染色体遗传连锁框架图总长度为466.7cM,标记平均间距为38.9cM,其中标记ILSTS049与CSRD264间距最大,为65.6cM,而BM2830和MCMA13间距最小,为4.9cM。图谱中13个标记的顺序与美国USDA-MARC和英国罗斯林研究所公布的SM4.7最新绵羊连锁图相同,但大部分标记间距大于后两者。 对参考群体中161个后代的10个重要性状的表型资料进行了分析。相关分析的结果表明初生重与初生毛长、初生弯曲数、二毛期活重、股部弯曲数间呈极显著正相关;初生毛长与初生弯曲数、花案清晰度间呈极显著正相关,与二毛期活重、肩部弯曲数、股部弯曲数呈显著正相关;初生弯曲数与花案清晰度、肩部弯曲数、股部弯曲数、弯曲比例呈极显著正相关,与毛股紧实度呈显著正相关;花案清晰度与弯曲比例呈极显著正相关;花穗类型与肩部弯曲数呈极显著正相关,与股部弯曲数呈显著正相关;毛股紧实度与肩部弯曲数、股部弯曲数、弯曲比例呈极显著正相关;肩部弯曲数与股部弯曲数、弯曲比例呈极显著正相关;股部弯曲数与弯曲比例呈显著正相关。方差分析结果表明家系(即公羊效应)对花案清晰度和毛股紧实度的影响不显著、对花穗类型影响显著之外对其余7个性状影响均极显著。最小二乘分析结果表明10个性状中除花案清晰度、毛股紧实度和花穗类型在各家系间差异不显著之外,其它各个性状在家系间存在不同程度的差异。 10个表型性状的QTL检测分析结果表明:QTL Express软件检测到了两个QTL区域,花案清晰度的QTL和花穗类型的QTL,但二者均未达到显著水平,未检测到明显的有关其他性状的QTL。……   
[关键词]:滩羊;二毛皮;微卫星;遗传连锁图谱;数量性状基因座
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:甘肃农业大学2008年