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基于线粒体序列变异探讨野猪系统地理学及家猪起源

李崇奇

  野猪(Sus scrofa)是家猪的祖先,广泛栖息于亚洲、欧洲及非洲北部。本文首先对系统地理学研究进展进行了综述,然后分别基于线粒体控制区(D-loop)序列、细胞色素b(cyt b)基因的遗传变异分析,探讨野猪的系统地理演化过程,并基于cyt b序列变异探讨了家猪的起源。具体包括以下几个部分:1、综述介绍了更新世时期全球环境周期性变化以及中国在更新世时期自然景观的变化,概述了系统地理学研究的基本理论及研究进展。2、研究测定了中国东北、华北及四川西部野猪72个个体线粒体控制区全序列,结合GenBank报道的日本野猪(S.s.leucomystax)、琉球野猪(S.s.riulduanus)72个控制区全序列,分析了东北亚地区野猪的线粒体DNA变异及系统地理格局。结果发现:(1)东北亚地区野猪控制区共有34个单元型,含42个变异位点。(2)东北亚地区野猪具有同一祖先,现生种群具有显著的种群遗传结构。(3)日本野猪与分布于中国东北野猪(S.s.ussuricus)间的亲缘关系较近,而琉球野猪与华北野猪(S.s.moupinensis)间亲缘关系较近。(4)巢式进化枝地理距离分析表明东北亚地区野猪由同一祖先经过长距离的迁徙而形成现生各种群(或亚种)。3、测定了中国东北、华北、华南及新疆、云南72头野猪的线粒体cyt b基因序列,并结合前人发表的资料,通过对238头野猪cyt b序列变异分析,探讨了野猪种群遗传结构及系统发生关系,分析其系统地理格局形成过程。研究表明:(1)238个序列发现变异位点128个,含74种单元型;(2)东北野猪与华南野猪亲缘关系很近,东北野猪可能是近期由华南野猪向北经长距离扩张而形成;(3)朝鲜野猪(S.s.coreanus)并非东北野猪与日本野猪之间的过渡种群,朝鲜半岛可能并非大陆野猪迁入日本的通道。(4)在冰期亚平宁半岛为欧洲野猪的一个避难所,但冰期后该地区野猪并没有能通过阿尔卑斯山脉向欧洲大陆扩张;欧洲大陆野猪(S.s.scrofa)可能是南部小亚细亚或巴尔干……   
[关键词]:野猪;家猪;控制区;细胞色素b基因;系统地理学;起源
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:南京师范大学2005年