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嗜盐古生菌ZJ204与ZJ206的16S rDNA及br基因核心序列分析

徐晓红

  嗜盐古生菌作为一种微生物资源,越来越引起科学界的重视,它不仅为微生物生理、遗传及分类、生命科学及相关学科许多领域的研究提供新的课题,也为生物进化、生命起源的研究提供新的材料.细菌视紫红质是一种存在于某些嗜盐古生菌细胞膜上,具有光驱动质子泵功能的跨膜蛋白,迄今为止已被当作光合作用、质子泵和七螺旋跨膜的受体模型进行研究.从新疆阿尔金山阿牙克库木湖分离纯化得到嗜盐古生菌AJ6,革兰氏染色呈阴性、杆状、少数球形、菌体大小为0.2-0.6×1.6-4.2 μm,最适NaCl和Mg~2+浓度分别为15%和O.6%(w/v),在pH6-7条件下生长良好.从浙江省舟山市普陀区朱家尖泗苏村泗苏盐场海水水样分离出的嗜盐菌株ZJ204和ZJ206,革兰氏阳性,不运动,液体培养时细胞呈杆状.在此基础上,进一步通过PCR方法扩增了菌株AJ6,ZJ204和ZJ206的16S rRNA基因(16SrDNA),测定了该基因的核苷酸序列,并利用“DNASTAR”软件包和“MEGA2”软件分析16S rDNA序列,对其进行同源性比较和系统发育学分析,建立了嗜盐古细菌的系统发育树.结果表明菌株AJ6与Nnm.sp.XA3-1和Nnm.ajinwuensis分在同一类群中,16SrDNA序列同源性分别为97.7%和97.9%:ZJ3204与ZJ206序列同源性为99.0%,二者与Hfx.alexandrinus,Hfx.volcanii,Hfx.lucentense分在同一类群中,ZJ204与它们的16S rDNA序列同源性分别为96.7%,96.9%,97.2%,ZJ206与它们的16S rDNA序列同源性分别为95.7%,95.9%,96.3%.可见,菌株AJ6是Natrinema属下的一个新成员,菌株ZJ204,ZJ206是Haloferax属下的新成员.菌株.AJ6,ZJ204,ZJ206的16S rDNA序列已登陆到GenBank,其序列号为AY277584,AY838279,AY838278.另外,通过PCR方法扩增了菌株ZJ204,ZJ206的br基因核心序列,其GenBank登陆号分别为AY838280,AY838281.将br基因核心序列翻译成氨基酸序列后,与现有BR蛋白螺旋C至螺旋G的氨基酸序列比较,发现其差异显著,具有深入研究价值.……   
[关键词]:嗜盐古生菌;海洋;系统发育;16S rDNA;细菌视紫红质
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:浙江大学2005年