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鸭科鸟类分子钟标定研究

孟冬梅

  本实验测定了中国家鹅15个品种、欧洲鹅2个品种共44个个体的细胞色素b基因(Cytb)全序列,分别取鸿雁和灰雁家鹅的一致序列与GenBank库中的13条鸟类(鸡形目4条、鸭科鸟类9条)细胞色素b基因部分序列(1045bp)共15条序列构成本研究的数据集。经过二簇检验、分枝长度检验和相对速率检验,删除2条速率不恒定的序列(黑海番鸭和美洲潜鸭)后,用剩余的13条序列,以鸡形目与雁形目(鸡/绿头鸭)的分歧时间(89.8MYA)为锚定点,用顺序标定法标定鸭科鸟类分子钟的分析结果表明,用“1+2TiTv”分析得到的鸭科鸟类的分歧时间比较可靠;氨基酸序列用泊松校正模型和Γ模型估计的分类单元间的分歧时间则比较一致,表明氨基酸序列更适合用于鸭科鸟类分子钟的研究;用同一基因标定分子钟时,较长序列得到的结果标准误比较小;与核苷酸序列相比,氨基酸序列更适于用作分子钟的标定。估计雉科与鸭科、雁属与鸭亚科、河鸭属与其它4个鸭属(鹊鸭属、绒鸭属、栖鸭属、斑胁草雁)间的分歧时间分别为116.3785MYA(“1+2TiTv”)和101.798MYA(泊松校正模型)和129.461MYA(Γ模型)、71.2247MYA(“1+2TiTv”)和55.1225MYA(泊松校正模型)和62.52231MYA(Γ模型)、36.8749MYA(1+2TiTv)和32.9498MYA(泊松校正模型)和35.5044MYA(Γ模型)。雉科与鸭科、雁属与鸭亚科两个接近基部类群的分歧时间发生在白垩纪(110-66MYA),支持鸟类早期历史发生在白垩纪的观点。……   
[关键词]:分子钟;细胞色素b(Cytb);锚定点;鸭科;进化速率
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:四川农业大学2004年