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肉牛微卫星DNA的群体遗传变异分析及其与肉用性状关系的研究

曹阳

  本研究选用了延边黄牛、利木赞牛、夏洛莱牛、利木赞和延边黄牛杂种及夏洛莱和延边黄牛杂种牛5个品种/杂种作为实验动物群体。利用PCR-SSLP技术及聚丙烯酰胺凝胶电泳法分析了5个品种/杂种群体中5个微卫星位点的遗传结构和遗传变异。根据5个微卫星多态计算的各群体间的标准遗传距离进行了聚类分析。并对微卫星位点克隆测序,进行了微卫星序列及其同源性分析。以肉牛线性体型评分作为衡量牛生长发育的指标,运用最小二乘法拟和线性模型,分析了肉牛生产性状与微卫星标记的关系,所得结果如下:1.利用5个微卫星座位ETH10、IDVGA46、IDVGA44、ETH225和BM2113,分析了5个品种/杂种牛群体的遗传结构、遗传变异。其多态信息含量分别是:延边黄牛为0.43016、0.36482、0.53231、0.58535和0.61386,利木赞牛为0.64475、0.65003、0.63067、0.42785和0.55469,夏洛莱牛为0.37500、0.59259、0.44963、0.44963和0.37500,利木赞和延边黄牛杂种牛为0.28906、0.19784、0.53038、0.69915和0.53072,夏洛莱和延边黄牛杂种牛为0.57518、0.19784、0.77480、0.65841和0.54334。杂合度和有效等位基因数范围分别为0.2094-0.8015、1.2649-5.0378。根据5个微卫星多态计算的各群体间的标准遗传距离,利用邻结法绘制系统聚类图,能比较准确地反映这5个品种/杂种的地理分布和它们之间的亲缘关系。并计算了5个微卫星座位在5个肉牛群体的平均等位基因数、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度。其中平均多态信息含量(PIC)和平均杂合度均最高为利木赞(0.58,0.63),最低为利延杂交牛(0.45,0.48)。在延边黄牛群体中,其数值分别是5.80、0.51、2.33和0.56,表现为高度多态性。2.本研究所使用的5个微卫星位点的序列测定结果表明ETH10、IDVGA46和IDVGA44为完全的(GT)_n型重复的微卫星,BM2113为完全的(CA)_n型重复微卫星,ETH225为不完全的微卫星(TG)_4(CG)(CA)_(15)。并且这5个微卫星序列与NCBI(National Center for Biotechnology Information)公布的相应位点序列的同源性都在96%以上。3.以肉牛线性体型评分方法作为衡量肉牛生长发育的指标,运用最小二乘法拟合线性模型,分析了微卫星ETH10、IDVGA46和BM2113位点的不同基因型与肉用生产性状的关系分析。结果初步说明微卫星EHT10位点的等位基因209延边大学硕士论文对外貌线性评定中的背线性状、肌肉度线性评定中的肩部性状有正面影响,等位基因213对外貌线性评定中的系部、肌肉度线性评定中的民形状和细致度线性评定中的骨骼及皮肤性状有正面影响,而等位基因215对外貌线性评定中的背线性状、肌肉度线性评定中的民形状有负面影响;微卫星DVGA46位点的等位基因249对背线、前肢和后肢等外貌线性评定性状,肌肉度线性评定的腰宽以及细致度线性评定的骨骼和皮肤性状有正面影响,等位基因203对外貌评定性状的头部、背线,肌肉度评定性状腰宽以及细致度评定性状骨骼和皮肤有负面影响,等位基因245对腰宽性状也起到负面影响。在本研究中仅发现一个对腰厚性状有正效应的等位基因205个体,这可能由于役肉兼用型延边黄牛肌肉度评分低于肉用型皮埃蒙特牛的原因,而没有发现对肩部发育有负面影响的等位基因2 11(只在南阳牛和杂种牛中存在);微卫星BMZll3位点,在外貌评定性状前肢,基因型1261134个体的最小二乘均值显著高于128/132、1321132基因型个体;在肌肉度评定性状肩部,基因型13211犯个体的最小二乘均值显著显著低于1301130、1241140、128/132基因型个体(P<0.05),民形状评分,基因型1261134个体最小二乘均值显著高于1301130基因型个体(P<0.05)。……   
[关键词]:肉牛;微卫星DNA;遗传变异;肉用性状;线性体型评分
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:延边大学2003年