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猪H-FABP和A-FABP基因的多态性及其与肌内脂肪性状关系的研究

王存芳

  猪的肉质性状是一个重要的经济性状,与生长性状或胴体性状间常表现为负的遗传相关,产肉力与肉质间存在一定的拮抗关系。如瘦肉率的提高使得猪肉中平均肌内脂肪的含量低于了最佳范围,从而影响了肉的嫩度和风味,肉质变劣,口感变差。而传统的育种手段很难使肉量和肉质均得以提高。因此,育种者们努力寻找影响肉质性状的主效基因及QTL_(?)候选基因法是研究动物数量性状遗传机制经常采用的方法之一,目前已确定H-FABP和A-FABP基因是影响猪肌内脂肪含量的主要候选基因。本研究选用4个国外猪种杜洛克、汉普夏、长白猪、大约克和1个中国地方品种莱芜猪共207头作为供试群体,利用PCR-RFLP技术和微卫星方法分别对可作为IMF含量候选基因的H-FABP和A-FABP基因进行了研究分析,同时对A-FABP基因的微卫星位点进行克隆测序,并分析了两基因的遗传变异与IMF含量的关系,目的是为确定影响肌内脂肪沉积的主效基因或与其紧密连锁的遗传标记奠定基础。本课题利用PCR-RFLP技术对五个猪种H-FABP基因的研究发现,H-FABP基因的5’上游区存在HinfⅠ-RFLP,第二内含子区存在HaeⅢ-RFLP和HinfⅠ-RFLP,与文献报道的基本一致,但酶切位点的各等位基因频率明显不同。在莱芜猪、杜洛克、汉普夏、长白猪、大约克中HinfⅠ-RFLP等位基因H的频率分别为:0.6087、0.5227、0.25、0.8511、0.7273;HinfⅠ-RFLP等位基因B的频率分别为0.5937、0.3478、0.6000、0.1154、0.3750;HaeⅢ-RFLP等位基因D的频率分别为0.8158、0.6429、0.9643、0.2778、0.6522。三种酶切位点中,五个猪种之间遗传特性的差异也非常明显,HinfⅠ-RFLP中除长白猪表现为低度多态,PIC<0.25)外,其余四个猪种均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5)。在HaeⅢ-RFLP中,汉普夏猪种表现为低度多态(PIC<0.25),而其余四个猪种均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5)。杜洛克的HinfⅠ-RFLP表现为明显的高度多态(PIC>0.5),其余四个猪种均为中度多态(0.25<PIC<0.5)。本研究对A-FABP基因进行了微卫星分析,在五个供试猪种中均检测到了(CA)_?位点,共发现了4个等位基因,10种基因型。经克隆测序发现,4个等位基因微卫星序列的重复数目分别为:A(33)、B(27)、C(23)、D(21);片段长度依次为A(279bp)、B(265bp)、C(257bp)、D(253bp)。该位点的多态性是由(CA)重复序列的差异引起的,四个等位基因的侧翼序列具有97.58%的同源性,等位基因C与Genebank中注册的野猪A-FABP基因全序列中的微卫星序列(序列号为SSY16039)完全一致。等位基因及基因型在五个猪种中的分布极不均衡,基因C为莱芜猪、长白猪的优势等位基因,基因A在杜洛克、大约克中为优势基因,而汉普夏以基因B为优势基因。莱芜猪、杜洛克在此位点上为明显的高度多态(PIC>0.5),而其余3个品种均表现为低度多态(PIC<0.25)。另外,还发现了两个山乐农业大学顾士学位论文(ZopZ)碱基的突变:C—T和A一勺。等位基囱B和C中存在这两个碱基突变,而等位基因D中只有C——T的突变,等位基因A不存在碱基突变。通过最小二乘分析发现,H-FABP基因的 hh-ddBB单倍体(Hinf.hh,HMllldd,HinfJ二BB)具有最高的 IMF含量,在各个 PCR-yLP。中,基因型dd、讪和Bb分别具有最高的最小二乘均值。微卫星(CA)。位点的纯合基因型间,基因型*D的!*F含量最高(5.肪H%),基因型*C次之,为4。引08%:基因型*C的最小二乘均值最高,其对IMi含量的效应值最大。综台以上研究结果,在后续工作中,需要更大的群体规模,采用家系设计,联台更多相关的旭选基因或DNA tie记来进行分析,寻求与IMF沉积紧密连锁的逅传0记,以便在动物育切实践的标记辅助选择(h4AS ) 中发挥遗传改良作用。……   
[关键词]:;候选基因法;H-FABP基因;A-FABP基因;IMF性状
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:山东农业大学2002年