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绒山羊11号染色体遗传连锁图谱的构建

王敏

  本研究利用内蒙古白绒山羊的5个父系半同胞家系共632个个体,分析了绒山羊基因组第11号染色体上7个微卫星标记的等位基因频率、多态信息含量和群体杂合度,构建了11号染色体遗传连锁框架图谱。 建立了包含有完备的系谱记录和详细的生产性能记录的2799只内蒙古白绒山羊的DNA样品库,可以用于多种数量遗传学和分子遗传学研究。 7个微卫星标记位点标记都呈现高度多态性,杂合度处于0.5886~0.9348之间,该5个家系的平均杂合度为0.8612,多态信息含量为0.7712~0.8990,平均多态信息含量为0.8472。 证明当用Cervus3.0进行内蒙古白绒山羊群体亲子鉴定和系谱验证时,用本试验采用的具有高度多态性的7个微卫星标记,采用5个标记的累计非父排除率就可以达到97.30%,采用7个标记可以达到99.93%。本实验进行系谱验证时,当置信度为95%,最终采用5个家系中的632个个体通过系谱验证。经系谱确认分析,五个家系置信度分别为98.3%、96.6%、95.6%、96.1%和97.0%,达到了作图群体的要求,家系中的个体数从89到172不等。 本实验构建的内蒙古白绒山羊11号染色体连锁框架图总长度为101.9cM,标记平均间距为16.99cM。其中标记ILSTS028与INRA108间距最大,为41.2cM,而ILSTS049和INRA131间距最小,为5.1cM,结果绘制成连锁图。本实验构建的连锁图谱与Vaiman等(1996)构建山羊的低分辨率连锁图谱差异显著;与英国罗斯林研究所公布的SM4.7(2007)绵羊该7个标记顺序完全相同,图距稍有差异。……   
[关键词]:绒山羊;微卫星标记;11号染色体;遗传图谱
[文献类型]:硕士论文
[文献出处]:内蒙古农业大学2011年