手机知网 App
24小时专家级知识服务
打 开
手机知网|搜索

PCR-DGGE技术分析蛋鸡MHC基因对肠道细菌种群结构的影响

倪学勤;Joshua Gong;Shayan Sharif;曾东

  研究蛋鸡MHC(Major Histocompatibility Complex,主要组织相容性复合物)基因对不同周龄和不同部位肠道细菌种群结构的影响。使用基于16S rDNA的PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)技术,结合特异性和共性条带割胶回收DNA进行克隆和测序,对2,4,6和8周龄商品蛋鸡和15I_5系蛋鸡嗉囊、十二指肠、空肠、回肠和盲肠内含物细菌群落的结构和多样性进行比较,并鉴定8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员。商品蛋鸡和15I_5系蛋鸡盲肠细菌的多样性均最高,其次是回肠和空肠,嗉囊和十二指肠的细菌多样性比较低,而且随着蛋鸡周龄增加,各肠段细菌多样性呈上升趋势,MHC基因对细菌多样性无显著影响。DGGE图谱聚类分析表明,蛋鸡MHC基因对4周龄和6周龄肠道细菌的影响最大,对8周龄影响较小,对2周龄影响最小;而且MHC基因对消化道前段细菌的影响小于对后段影响。序列分析发现,8周龄商品蛋鸡和15I_5系蛋鸡均有大量的三得利乳杆菌(Lactobacillus suntoryeus),是蛋鸡消化道前段的优势细菌;商品蛋鸡空肠、回肠和盲肠中的特异性条带主要是Ochrobactrum spp,索氏梭菌(Clostridium sordellii),超巨巨单胞菌(Megamonas hypermegale)和大量不可培养的细菌;15I_5系蛋鸡的特异性条带主要是不可培养的细菌。该研究结果表明蛋鸡MHC基因可影响不同周龄、不同肠段细菌群落的结构。……