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中国南方地区H9N2亚型禽流感病毒2002-2009年分离毒株HA基因功能进化分析

白斯伟;吴志强;覃健萍;陈峰;毕英佐;谢青梅

  为研究我国南方地区H9N2亚型禽流感病毒血凝素HA基因的变异情况和分子进化,本研究对来自广东、湖南等省份的47株H9N2亚型禽流感病毒HA基因进行了克隆测序及系统发育进化分析,并与国内疫苗毒株进行比较,力图从分子水平探讨我国H9N2亚型禽流感病毒的演化和变异规律。结果显示47个毒株之间核苷酸相似性为92.5%-100%之间,推导氨基酸相似性为94.3%-99.6%;与三株疫苗毒株比较核苷酸相似性为91.7%-96.6%,推导氨基酸相似性为92.3%到95.7%。47个毒株与三株疫苗毒株相比较,其中有7处位点发生突变。其中Q216L位于HA蛋白受体结合位点(RBS)上,且全部突变为亮氨酸。此外,相比三株疫苗毒株,2005年至2009年分离得到的毒株在HA1蛋白的第295位氨基酸处增加一个PGS。本试验从一定程度上反映出国内近年流行H9N2亚型禽流感优势毒株与国内一些疫苗毒株有一定的进化距离。……