手机知网 App
24小时专家级知识服务
打 开
手机知网|搜索

牛蛙皮肤抗菌肽的cDNA克隆及序列分析

赵瑞利;韩文瑜;雷连成;韩俊友;冯新;江丽娜;孙长江;张俊敏;欧阳萍

  为研究牛蛙皮肤抗菌肽的多样性及其结构特点,根据GenBank数据库中蛙属抗菌肽基因信号肽序列设计简并引物,以RT-PCR技术扩增牛蛙皮肤抗菌肽基因,克隆得到cDNA全长序列并进行测序和序列分析。用生物信息学软件分析其cDNA序列特点,预测成熟肽的理化性质。结果得到了48个完整的cDNA序列,分别编码19种抗菌肽前体,它们均有信号肽、前导肽和成熟肽三部分组成。对序列测定结果的预测分析表明:牛蛙皮肤抗菌肽前体与已报道的其它蛙类抗菌肽具有较高的同源性,同源性达到80%以上,但成熟肽的序列变异很大,具有物种特异性,其中6个为新报道的抗菌肽序列。推测得到的19种抗菌肽成熟肽除2个分别属于Brevinin和Temporin家族外,其它多属于Ranatuerin家族,而catesbeianin1-6至今则未见相似序列报道,为新的抗菌肽家族序列。牛蛙皮肤抗菌肽成熟肽的二级结构主要以α-螺旋和β-折叠为主,均为疏水性短肽。上述信息为进一步研究牛蛙皮肤抗菌肽的生理生化特点、药用活性以及原核表达奠定了基础。……