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新城疫病毒鹅源毒株ZJ1株全基因组的序列测定

黄勇;万洪全;刘红旗;吴艳涛;刘秀梵

  依据GenBank上公布的鸡新城疫病毒(NDV)的基因序列,自行设计了9对引物。运用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)获取覆盖NDV鹅源毒株ZJ1株全基因组的重叠片段。病毒RNA的5’及3’端的序列由cDNA末端快速扩增技术(RACE)获取。整个病毒基因组序列由15192个碱基组成,比GenBank上公布的其他4个NDV毒株Beaudette C、B1、La Sota及Clone-30的全基因序列长6个核苷酸,这6个核苷酸位于核衣壳蛋白(NP)基因内,相对于NDV毒株La Sota株全基因序列的1647nt-1648nt位,其他9个NDV毒株也被验证是否存在此6个额外的核苷酸。实验结果表明共8个NDV毒株具有此特征.他们分别属于3个不同的基因型。……