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猪瘟病毒强弱毒株和野毒株E2全基因序列测定及比较分析

王琴;王在时;李博;丘惠深;郎洪武

  为了比较猪瘟病毒(HCV)野毒株、疫苗株及标准株之间E2基因抗原区域的差异,采用RT—PCR扩增了HCV石门株、兔化弱毒疫苗株、野毒03及07株的囊膜糖蛋白E2(gp55)全基因的cDNA片段,分别克隆于pGEM—T载体中并对其进行了核苷酸序列测定及氨基酸序列的推导,同时进行了同源性比较及E2结构与功能的分析。所测4株HCV E2基因的长度均为1273bp,所编码的氨基酸序列均包括部分信号肽序列和完整的跨膜区序列,共由381个氨基酸组成;4个毒株E2蛋白N末端的683位至690位信号肽序列(WLLLVTGA)和C末端1030~1063位跨膜区均为保守序列,而且具疏水性;N末端抗原功能区中,4个E2蛋白与其它所比较序列在位于第753位至759位氨基酸处,均有一段保守序列RYLASLH,无一氨基酸发生变异,为亲水性,在整个E2蛋白抗原谱中抗原性峰值为最高,推测对抗原性产生起重要作用;4个E2蛋白的氨基酸序列中均含有15个半胱氨酸(Cys)残基,其数量及位置与国外五株HCV(Brescia, C, Alfort.ALD和GPE)完全一至。表明该4株HCV E2抗原具有相同的构型,尤其是N末端的6个Cys残基对E2蛋白结构的正确折叠及特异抗原决定簇的形成至关重要。同时对主要抗原区域氨基酸位点变异进行分析,发现疫苗株与野毒株之间抗原决定簇未发生明显变异。……