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四个新城疫病毒强毒株HN基因的同源性分析

丁壮;金宁一;王兴龙;金扩世;李太元;吕杰;米志强;夏志平;殷震

  新城疫病毒(NDV)四平株、昌黎株、青岛株、F48E8株分别接种9日龄SPF鸡胚增殖,蚀斑纯化(三代),生物学特性鉴定及结合基因序列分析,表明NDV四平株、昌黎株、青岛株均为强毒株。经差速、蔗糖密度梯度离心提纯病毒,分别提取RNA,利用一对特异性引物及RT—PCR方法,一次性扩增出NDV四平株、昌黎株、青岛株和F48E8株的全长HN基因,分别将该HN基因克隆入载体pKS(-)并进行测序。序列分析表明。这四个毒株HN基因核苷酸长度均为1713bp,编码571个氨基酸,其中四平株和F48E8株含有5个糖基化位点,青岛株和昌黎株含有6个糖基化位点,四平株含有12个半胱氨酸残基,而昌黎株、青岛株和F48E8株含有13个半胱氨酸残基。三个野生毒株与F48E8相比较,核苷酸序列同源性为85.7%~99.3%,推导的氨基酸序列同源性为89.5%~98.8%,其中NDV四平株与标准强毒F48E8同源关系最近,核苷酸同源性为99.3%,推导的氨基酸同源性为98.8%。……