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茶树叶片ESTs序列及其功能基因表达谱特征分析

赵丽萍;陈亮;高其康

  在建立龙井43春季叶片cDNA文库后,进行了高通量的cDNA克隆测序,共获1684个高质量的表达序列标签(ESTs),并与NCBI的非冗余核酸与蛋白质数据库进行BlastN、BlastX比对,分别表明607个和1008个ESTs为已知功能或具推测功能基因,占总数的63.8%和28.7%。为了对茶树叶片基因表达谱有更加深入的了解,按照拟南芥功能基因分类标准,把BlastX比对结果中具有已知功能或推测功能的1008个ESTs,根据所参与的细胞过程将其分为12大类,即代谢相关基因占8.3%、能量相关基因占26.4%、细胞生长与分化基因占3.8%、转录相关基因占3.9%、蛋白质合成相关基因占17.9%、蛋白质降解和储藏相关基因占1.7%、运输相关基因占4.7%、细胞结构相关基因占10.7%、信号传导相关基因占5.4%、抗病与防御占9.2%、次生代谢相关基因占3.5%以及功能不明确占4.7%。ESTs测序分析不仅为在短时间内获得大量的功能基因,而且为某一特定组织、器官或环境条件下的基因表达谱特征研究提供了一个经济、快速和高效的捷径。……